แต่เดิมวัดถวิลศิลามงคล เป็นสำนักสงฆ์มาก่อน ชื่อ “สำนักสงฆ์ชัยมงคล” ตั้งอยู่ในเขตพื้นที่ท้องนา ซึ่งที่ดินผืนนี้เป็นของนายธูป นางกิมฮอง เนียรมงคล ได้ถวายที่ดินผืนนี้ให้เป็นเขตพุทธาวาส จำนวน 11 ไร่ 2 งาน ในปี พ.ศ. 2522 โดยมีพระอาจารย์โกวิทเป็นประธานฝ่ายสงฆ์ ต่อมาพระอาจารย์โกวิทมีความขัดข้องกับชาวบ้านและได้เดินทางออกจากสำนักสงฆ์ไป สำนักสงฆ์จึงว่างลง

ต่อมาพระอาจารย์สุภาพ กิตฺติญาโณ ท่านได้เดินธุดงค์มาจากวัดนครเนื่องเขต (วัดต้นตาล) จนมาเจอสำนักสงฆ์ชัยมงคลแห่งนี้ ซึ่งอยู่ไม่ไกลจากวัดนครเนื่องเขต (วัดต้นตาล) ท่านจึงมาพำนักอยู่ที่นี่ ชาวบ้านในละแวกนี้จึงนิมนต์ท่านให้อยู่จำพรรษา แต่ท่านก็ยังเดินทางไปมาระหว่างวัดนครเนื่องเขตและสำนักสงฆ์ชัยมงคล

จนกระทั่งวันที่ 27 มกราคม พ.ศ. 2526 สำนักสงฆ์แห่งนี้ได้รับการยกฐานะขึ้นเป็นวัด มีนามว่า “วัดถวิลศิลามงคล” โดยมีพระอาจารย์สุภาพ กิตฺติญาโณ ขึ้นดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาส

ต่อมา เมื่อวันที่ 7 เมษายน พ.ศ. 2541 พระอธิการสุภาพ ได้เริ่มดำเนินการก่อสร้างกุฏิ หอฉัน ศาลาการเปรียญ เมรุ ศาลาสังเวช หอระฆัง และอุโบสถ เพื่อให้วัดมีความสมบูรณ์ในด้านเสนาสนะและสามารถรองรับพุทธศาสนิกชนที่มาทำบุญได้อย่างทั่วถึง